SUMMARY OF PM7 CALCULATION, Site No: 23746
MOPAC2016 (Version: 21.053M)
Tue Feb 23 01:53:53 2021
No. of days remaining = 364
Empirical Formula: C40 H52 N20 O16 = 128 atoms
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Adenosine (ADENOS11)
GEOMETRY OPTIMISED USING EIGENVECTOR FOLLOWING (EF).
SCF FIELD WAS ACHIEVED
HEAT OF FORMATION = -662.50910 KCAL/MOL = -2771.93808 KJ/MOL
H.o.F. per unit cell = -165.62728 KCAL, for 4 unit cells, unit cell = C10 H13 N5 O4
TOTAL ENERGY = -14064.32766 EV
ELECTRONIC ENERGY = -56934565.55491 EV
CORE-CORE REPULSION = 56920501.22726 EV
VOLUME OF UNIT CELL = 537.088 CUBIC ANGSTROMS
DENSITY = 1.652 GRAMS/CC
A = 12.414 ANGSTROMS
B = 9.886 ANGSTROMS
C = 4.451 ANGSTROMS
ALPHA = 90.014 DEGREES
BETA = 100.494 DEGREES
GAMMA = 89.686 DEGREES
VOLUME OF CLUSTER = 1074.17685 ANGSTROMS**3 = 646.884 CM**3/MOLE
GRADIENT NORM = 13.35417 = 1.18035 PER ATOM
NO. OF FILLED LEVELS = 204
IONIZATION POTENTIAL = 9.311838 EV
HOMO LUMO ENERGIES (EV) = -9.312 -1.042
MOLECULAR WEIGHT = 1068.9752
Pressure required to constrain translation vectors
Tv( 129) Pressure: 0.60 GPa
Tv( 130) Pressure: 0.12 GPa
Tv( 131) Pressure: 0.04 GPa
SCF CALCULATIONS = 36
WALL-CLOCK TIME = 9 MINUTES AND 17.005 SECONDS
COMPUTATION TIME = 9 MINUTES AND 11.996 SECONDS
FINAL GEOMETRY OBTAINED
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Adenosine (ADENOS11)
N 0.26253901 +1 0.03304397 +1 -0.26341491 +1
C 1.58360162 +1 0.08764502 +1 -0.56537324 +1
N 2.35747490 +1 1.18926522 +1 -0.52891605 +1
C 1.69384878 +1 2.31890757 +1 -0.17505549 +1
C 0.29473288 +1 2.40551344 +1 0.11702362 +1
C -0.43046151 +1 1.17768355 +1 0.04832723 +1
N -0.02160126 +1 3.72799206 +1 0.42563746 +1
C 1.11408694 +1 4.42138833 +1 0.35599774 +1
N 2.19947113 +1 3.60149091 +1 -0.03065854 +1
N -1.75910803 +1 1.08323198 +1 0.24492563 +1
C 3.56832529 +1 3.99471310 +1 -0.35699920 +1
C 3.82931589 +1 3.87559141 +1 -1.88432277 +1
C 3.67399664 +1 5.32986705 +1 -2.39534719 +1
C 3.67698773 +1 6.20888017 +1 -1.13620829 +1
C 2.45668042 +1 7.12599607 +1 -1.00936628 +1
O 3.72063330 +1 5.33997703 +1 0.00308648 +1
O 5.09993222 +1 3.38906074 +1 -2.18270848 +1
O 4.68798660 +1 5.69779620 +1 -3.28001044 +1
O 2.56247171 +1 7.73746718 +1 0.25741593 +1
N -1.54889213 +1 -2.42447316 +1 7.02629528 +1
C -2.86998306 +1 -2.15697249 +1 7.13090892 +1
N -3.59698600 +1 -1.35803109 +1 6.32322611 +1
C -2.86716172 +1 -0.77164238 +1 5.33245753 +1
C -1.45965708 +1 -0.96272390 +1 5.12837751 +1
C -0.79282841 +1 -1.83294305 +1 6.04179688 +1
N -1.05248503 +1 -0.20770082 +1 4.03169434 +1
C -2.13931010 +1 0.40407387 +1 3.56257083 +1
N -3.27948213 +1 0.10507531 +1 4.34166101 +1
N 0.53021832 +1 -2.08059672 +1 6.01315058 +1
C -4.60721671 +1 0.71754960 +1 4.23635153 +1
C -4.89540147 +1 1.63297180 +1 5.46115118 +1
C -4.66499271 +1 3.07039730 +1 4.92439715 +1
C -4.56387210 +1 2.90683648 +1 3.39578080 +1
C -3.27177586 +1 3.45098960 +1 2.78250774 +1
O -4.62946283 +1 1.50629723 +1 3.08413819 +1
O -6.23942385 +1 1.50303047 +1 5.83488098 +1
O -5.66678292 +1 3.95567757 +1 5.27941125 +1
O -3.31952137 +1 3.08806203 +1 1.42064756 +1
H -2.22386054 +1 0.18110288 +1 0.25995589 +1
H 2.06695475 +1 -0.86229899 +1 -0.86648230 +1
H 4.29084947 +1 3.42224696 +1 0.28882952 +1
H 3.15585474 +1 3.14626206 +1 -2.38731014 +1
H 1.24611050 +1 5.47464782 +1 0.57928870 +1
H -2.28301357 +1 1.89001710 +1 0.58317748 +1
H 2.75457169 +1 5.46594945 +1 -3.00945257 +1
H 4.62022318 +1 6.80691238 +1 -1.04706177 +1
H 2.44559132 +1 7.88749496 +1 -1.81390186 +1
H 1.49212286 +1 6.58524840 +1 -1.02260408 +1
H 5.78791045 +1 3.70292585 +1 -1.55586491 +1
H 5.60017121 +1 5.41024792 +1 -2.98091964 +1
H 2.68308680 +1 8.71922330 +1 0.15396946 +1
H -3.39831706 +1 -2.64637130 +1 7.97427598 +1
H -2.19889928 +1 1.04944289 +1 2.69060871 +1
H 1.09084580 +1 -1.74848374 +1 5.22600074 +1
H 0.95620020 +1 -2.74015864 +1 6.64949221 +1
H -5.36981067 +1 -0.08670094 +1 4.06217136 +1
H -4.27090755 +1 1.39734771 +1 6.34661968 +1
H -3.75217139 +1 3.52905135 +1 5.37011935 +1
H -5.45754845 +1 3.33980132 +1 2.88068673 +1
H -2.35475786 +1 2.99067197 +1 3.19364838 +1
H -3.19857670 +1 4.54730374 +1 2.89841417 +1
H -6.49375075 +1 0.54350941 +1 5.78626586 +1
H -6.58159869 +1 3.58591748 +1 5.09608241 +1
H -3.46491655 +1 3.88434758 +1 0.85039497 +1
N -2.69888195 +1 -1.08497053 +1 -3.56554183 +1
C -1.39060007 +1 -1.04276826 +1 -3.91931735 +1
N -0.59502966 +1 0.04142225 +1 -3.86976159 +1
C -1.21723593 +1 1.16804110 +1 -3.43710819 +1
C -2.60581465 +1 1.27156375 +1 -3.09905586 +1
C -3.35663863 +1 0.05978840 +1 -3.18309981 +1
N -2.87890257 +1 2.58542498 +1 -2.72117353 +1
C -1.72586377 +1 3.25161110 +1 -2.78417412 +1
N -0.67252113 +1 2.42720077 +1 -3.24018131 +1
N -4.67695443 +1 -0.03197681 +1 -2.92913848 +1
C 0.70692515 +1 2.80351427 +1 -3.55286831 +1
C 0.97011707 +1 2.67914878 +1 -5.08052150 +1
C 0.83187131 +1 4.13204831 +1 -5.59158763 +1
C 0.83202346 +1 5.01424618 +1 -4.33445801 +1
C -0.38859747 +1 5.93266251 +1 -4.20763405 +1
O 0.87809801 +1 4.14740055 +1 -3.19458341 +1
O 2.22681152 +1 2.14771320 +1 -5.35046022 +1
O 1.84892869 +1 4.47495224 +1 -6.48375634 +1
O -0.25335123 +1 6.59615717 +1 -2.97212337 +1
N -4.34441766 +1 -3.62735044 +1 3.75639354 +1
C -5.66715260 +1 -3.38307504 +1 3.87445102 +1
N -6.40838294 +1 -2.56546504 +1 3.09873561 +1
C -5.68437874 +1 -1.91671808 +1 2.14183614 +1
C -4.27385727 +1 -2.07906675 +1 1.92935652 +1
C -3.59632826 +1 -2.98536898 +1 2.79802569 +1
N -3.87376124 +1 -1.26427660 +1 0.87337424 +1
C -4.96682491 +1 -0.63811523 +1 0.43911309 +1
N -6.10549817 +1 -0.99407073 +1 1.19860412 +1
N -2.27474862 +1 -3.23189515 +1 2.75478170 +1
C -7.45631967 +1 -0.43235801 +1 1.09679698 +1
C -7.79295449 +1 0.44180323 +1 2.33708089 +1
C -7.60329903 +1 1.90138317 +1 1.84006929 +1
C -7.47884351 +1 1.77721954 +1 0.30964000 +1
C -6.20255395 +1 2.37077240 +1 -0.28975315 +1
O -7.49832889 +1 0.38216978 +1 -0.03515351 +1
O -9.14187653 +1 0.28378661 +1 2.68429903 +1
O -8.65467215 +1 2.72387398 +1 2.20673092 +1
O -6.21882746 +1 2.01000423 +1 -1.65418944 +1
H -5.13980034 +1 -0.93500483 +1 -2.92863659 +1
H -0.93675427 +1 -1.98747560 +1 -4.28200672 +1
H 1.42112306 +1 2.22496251 +1 -2.90580759 +1
H 0.28975101 +1 1.95135294 +1 -5.57753748 +1
H -1.55817563 +1 4.28785873 +1 -2.51330737 +1
H -5.17911098 +1 0.76331027 +1 -2.54111945 +1
H -0.08228323 +1 4.27996739 +1 -6.20994960 +1
H 1.77239871 +1 5.61790394 +1 -4.24372878 +1
H -0.43137358 +1 6.65940308 +1 -5.04227391 +1
H -1.34915983 +1 5.38764384 +1 -4.16500440 +1
H 2.95796968 +1 2.70442560 +1 -4.99909785 +1
H 2.77192973 +1 4.29110359 +1 -6.14538647 +1
H -0.03055684 +1 7.55582488 +1 -3.11562086 +1
H -6.18780767 +1 -3.91897449 +1 4.69321537 +1
H -5.02986630 +1 0.05863619 +1 -0.39261054 +1
H -1.71052402 +1 -2.85648232 +1 1.98901082 +1
H -1.84267168 +1 -3.91046763 +1 3.36830523 +1
H -8.18489916 +1 -1.26187035 +1 0.89477104 +1
H -7.18041750 +1 0.19870776 +1 3.22922576 +1
H -6.72323191 +1 2.38595512 +1 2.32066475 +1
H -8.38639671 +1 2.19098770 +1 -0.20096994 +1
H -5.27241148 +1 1.94728174 +1 0.13516202 +1
H -6.17688453 +1 3.46742106 +1 -0.17168649 +1
H -9.40639326 +1 -0.66046689 +1 2.54922718 +1
H -9.54149779 +1 2.36178390 +1 1.91439269 +1
H -6.31111370 +1 2.81057341 +1 -2.23000484 +1
Tv 10.90343612 +1 -2.37582650 +1 -5.43815324 +1
Tv 0.31215221 +1 9.22928808 +1 -3.52975632 +1
Tv -5.60164626 +1 -2.30734275 +1 -6.52215900 +1